生命教育以「人生三問」為基礎架構，所謂「人生三問」是指：人為何而活？應如何生活？要如何才能活出應活的生命？這三個最根本的生命課題。「第一問」探討的是「至善」（summum bonum），亦即人生最高的理想與目的或生命終極意義的問題；「第二問」則據以分辨人生應行的道路與方向；「第三問」關注知行合一之道，首要的功夫即在於人格的統整與靈性的提昇。當人能逐步做到知行合一，走在應行的道路上，就能一步一腳印地邁向人生的終極理想。
要答覆「人生三問」，必須以「思考素養」為方法，還必須以「人學探索」為基礎。「思考素養」關心思考的知識與技能，同時更關注思考應具備的情意與態度。「人學探索」則希望以人的結構、關係與過程做為理解人的架構，並以各種學科的特殊人學為內涵，對「人」進行跨科際、跨宗教、跨立場的探討。
